床の模様をカーペットに変更しましたが、Web3D出力時に映り込みが表示されてしまいます。

以下の2種類の対処方法があります。

「和室」の部屋パネルを利用する
「和室」のカテゴリの部屋パネルはWeb3D出力時に映り込みが表現されません。この性質を利用して、パネルの配置後に名前や床の設定を変更することで映り込みを表示させたくない部屋を表現が可能です。
間取のpsxデータを直接編集する
作成した間取のpsxデータをテキストエディタで開き、記述されている内容を変更することで、任意の部屋の映り込みの表現を解除することが出来ます。